感病甘蔗植株梢头长出一条黑色鞭状物称为黑穗，长达数厘米至几十厘米，感病的多为宿根蔗高位芽以及无叶鞘保护的种茎蔗芽长成的植株。感病初期蔗苗生长不良，叶片细、，黄绿色，基部节间极短，以后提早1-3个月拔节伸长(冬、春植蔗和宿根蔗的感病植株4-5月伸长)，蔗茎细，节间长，明显比其他蔗苗高。随着病情的发展，生长点长出黑穗，有时感病植株基部细小的分蘖也感病并陆续长出黑穗，而从地下长出的粗壮分蘖则较少感病。
防治方法
1.选用抗病品种。甘蔗品种对黑穗病只有感染程度不同，发病株率为10%-20%即算抗病品种。目前推广的多数品种较抗黑穗病。
2.采用梢部种茎。蔗梢的芽有叶鞘保护，黑穗病孢子不易散落到蔗芽上，带菌机会少，发病也少。
3.用新高脂膜浸泡种茎10分钟，驱避地下虫害，隔离病毒感染。
4.把地面上容易感菌的蔗芽( 即高位芽)砍掉，从地下低位芽长出来的蔗苗发病很少。
5.在病株节间已伸长，但尚未长出鞭状物时，即将病株拔除。如黑穗已形成，拨除的病株应集中烧毁，全园并喷施护树大将军消毒，抑制病菌复制，提高防治效果。
6.有条件的蔗区实行甘蔗与水稻、花生、黄豆、红薯等作物轮作。
