脐橙采果后及时的清园，可起到很好的防治病虫害的效果。在脐橙采摘后要做到彻底清除园内所有杂草与枯枝落叶等，并清除园间所有落果，尤其是掉落在地上布满绿霉、青霉的果实，集中带出园外销毁，可有效减少园间病菌侵染源。
脐橙采摘后修剪主要疏除树冠内部的荫蔽枝及树冠外部的病虫枝、纤弱枝、干枯枝、重叠枝、过密枝和采果时损伤的枝条，短截徒长枝和落花落果枝，以减少养分无用消耗；剪后伤口需及时涂抹愈伤防腐膜，可保护伤口愈合快、防病菌侵染。
清园结束后需全园喷施消毒剂加护树将军消毒杀菌，可在脐橙果树表面迅速形成一层荧光保护膜，阻碍越冬病毒着落于树体繁衍、保护花芽越冬免遭冻害、植体不干梢。
