根朽病症状主要为害根茎部，病部呈黄褐色坏死溃烂，由表皮向内部扩展蔓延，同时亦向上下发展。发病后期，根茎纵裂，重病植株根茎腐朽变糟，根系腐烂。随病害发展，植株萎蔫死亡。轻病株易从根茎处断折。雨后或浇水后病情加重，连茬种植病害发生相对较重，新种植地块也可发病。
防治方法:
（1）因地制宜选育和种植抗病品种。
（2）加强栽培管理。适期播种，合理密植；科学施肥，施用充分腐熟的有机肥，增施磷钾肥，提高植株抗病力；合理灌溉，避免大水漫灌，减少病害田间传播；生长期及时清除重病株，拉秧后彻底清除病株和病根残体，集中烧毁或深埋，全园及时喷施护树大将军消毒杀菌，减少传染源。
（3）药剂防治。应用根施通与护树将军配合灌根，能诱导病毒集结，供护树将军靶向消毒，抑制哈密瓜根部病毒传导式感染及叶片和果实，保养植株输导系统健康工作。
